技術(shù)文章
什么是代謝組學(xué)?
基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)告訴你什么可能會(huì)發(fā)生,而代謝組學(xué)則告訴你什么確實(shí)發(fā)生了。”(Bill Lasley, UC Davis)
代謝組學(xué),是效仿基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究思想,對(duì)生物體內(nèi)所有代謝物進(jìn)行定量分析,并尋找代謝物與生理病理變化的相對(duì)關(guān)系的研究方式,是系統(tǒng)生物學(xué)的組成部分。近幾年,代謝組學(xué)迅速發(fā)展并已滲透到多項(xiàng)領(lǐng)域,比如疾病診斷、醫(yī)藥研制開(kāi)發(fā)、營(yíng)養(yǎng)食品科學(xué)、毒理學(xué)、環(huán)境學(xué),植物學(xué)等與人類(lèi)健康護(hù)理密切相關(guān)的領(lǐng)域。
代謝物的分析挑戰(zhàn)?
高分辨率質(zhì)量 LC/TOF 或 LC/Q-TOF 是代謝組學(xué)研究工作中的常規(guī)工具。雖然 LC/TOF 或 LC/Q-TOF 在代謝組學(xué)中的應(yīng)用已發(fā)展多年,但在分析代謝物時(shí)仍存在一些挑戰(zhàn),例如:
代謝物離子在色譜柱上的保留
高鹽下代謝物的靈敏度抑制和重現(xiàn)性降低
生物相關(guān)異構(gòu)體的色譜分離
代謝物范圍廣,分離和精度難同時(shí)兼顧
安捷倫極性代謝物分析必殺技
為了解決代謝物分析難題,安捷倫采用 Agilent 1290 Infinity II 液相色譜(LC)結(jié)合 6546 四極桿飛行時(shí)間液質(zhì)聯(lián)用(Q-TOF)系統(tǒng),成功開(kāi)發(fā)出了針對(duì)極性化合物的分析方法。
表 1. 分析條件
該方法的分析結(jié)果表明:
極性代謝物有效分離分析
圖 1. 顯示極性代謝物在色譜柱上有良好的保留,并且能夠?qū)崿F(xiàn)基線(xiàn)分離,可以滿(mǎn)足多種極性代謝物同時(shí)監(jiān)控的要求。
有效提高代謝組學(xué)關(guān)注化合物的分析靈敏度和準(zhǔn)確度
圖 2. 連續(xù) 18 小時(shí)以上重復(fù)進(jìn)樣考量?jī)x器及方法的質(zhì)量精度穩(wěn)定性:A,負(fù)離子模式下的平均質(zhì)量誤差為 1.5 ppm;B,質(zhì)量誤差 RSD 為 1.25 ppm ( n = 47 種代謝物),說(shuō)明方法具有良好的質(zhì)量精度。
即使在高鹽濃度下,代謝物離子和極性代謝物的重現(xiàn)性也有較大提高
圖 3. AMP 和 ADP 在不同鹽含量下,略有差異,但是對(duì)響應(yīng)影響不明顯;而 ATP 在不同鹽環(huán)境下,靈敏度沒(méi)有差異;由此說(shuō)明,本方法穩(wěn)定性好、耐鹽,適合分析組織、體液等高鹽樣品。
通過(guò)色譜條件的優(yōu)化,對(duì)重要的生物異構(gòu)體基本實(shí)現(xiàn)了基線(xiàn)分離,并檢出了各類(lèi)的代謝物
圖 4. 生物相關(guān)異構(gòu)體能夠在色譜柱上基本實(shí)現(xiàn)基線(xiàn)分離,對(duì)分別剖析化合物結(jié)構(gòu),尤其分子量接近或一致的異構(gòu)體意義重大。
綜上所述,Agilent 1290 Infinity II 液相色譜、6546 四極桿飛行時(shí)間液質(zhì)聯(lián)用系統(tǒng)搭配 InfinityLab Poroshell 120 HILIC-Z 色譜柱,作為全面代謝組學(xué)分析的一個(gè)強(qiáng)有力解決方案,能夠解決極性代謝物分析難點(diǎn)。
文章來(lái)源:安捷倫視界公眾號(hào)